|
- 保姆级KEGG数据库教程!医学人如何入门KEGG?信号通路分析必学功能有哪些?不需要掌握的有哪些?
1 KEGG PATHWAY 这部分应该就是大家最熟悉的啦,也是KEGG数据库最核心的部分。 它包含了与通路相关的各种信息,我们解螺旋也有相关课程教大家使用,在此就不赘述。 2 KEGG BRITE 这部分是一个手动创建的分层文本文件的集合,捕获各种生物对象的功能层次结构。
- 为啥目标基因在kegg富集分析时,没有kegg pathway通路,只有kegg brite中的一个?
在进行KEGG富集分析时,如果发现目标基因只富集到了KEGG BRITE分类而不是经典的KEGG pathway,这可能意味着以下几种情况: 1 数据特异性: 你的基因集可能富含一些较为新颖或特定生物学功能的基因,这些功能可能还未被详细归纳到传统的KEGG pathway中,而是更多体现在KEGG BRITE分类里。KEGG BRITE是一个
- KEGG 怎么用? - 知乎
9 KEGG NETWORK 这部分和上面的KEGG DISEASE比较像,它是KEGG尝试从扰乱的分子网络中获取有关疾病和药物的信息。 这部分主要包含了癌症、内分泌和代谢性疾病、病毒和细菌感染三部分内容。 10 KEGG DRUG 这部分包含的药物为在日本和美国上市的药物。
- 请问如何检索kegg数据库? - 知乎
Para_04 KEGG数据库内部存储为Oracle关系数据库。 对于外部服务,生成了平面文件以便由DBGET系统处理(4),该系统已被用作KEGG中的基本检索系统。 然而,目前其搜索功能正在被SQLite接口取代,DBGET主要被用于通过KEGG标识符检索和查看数据。
- GO和KEGG分析怎么筛选自己想要的基因啊? - 知乎
GO和KEGG分析怎么筛选自己想要的基因啊? 做了干旱胁迫转录组,做了差异基因GO和KEGG分析,我应该怎么筛选和干旱有关的词条啊? 一般显著的p值低于多少啊,我做的分析里面没有标注显著。 go词条… 显示全部 关注者 77
- 请问KEGG特异性通路图怎么看? - 知乎
请问KEGG特异性通路图怎么看? 刚入行小白提问,一个物种的KEGG特异性通路图,基因标注有白框的和绿框的。 绿框的是一定存在的基因吗? 白框的是一定不存在的基因吗? 这里面有什么门道吗? 显示全部 关注者 4 被浏览
- 知乎
知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容,聚集了中文互联网科技、商业、影视
- 请问如何检索kegg数据库? - 知乎
1、什么是KEGG? KEGG,Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因和基因组百科全书,是系统分析基因功能,联系基因组信息和功能信息的知识库。KEGG是一个综合数据库,它们大致分为系统信息、基因组信息、化学信息和健康信息四大类。KEGG PATHWAY是最核心的数据库之一。
|
|
|